HPC新突破,基因检测新动力!

基因检测以前对普通人来说,是一项复杂且遥远的技术。
然而,新冠疫情的突如其来,让快速、准确的核酸检测成为了防控疫情的有效方式,这是一次基因检测技术对新发传染病进行干预的有益实践,也让基因检测快速地进入了大众视野。
随着大数据与生物医学的不断融合,越来越多的创新型大数据应用场景不断涌现,但在发展过程中,越来越多基因行业的研究机构和企业发现,保障后端算力非常重要,因此寻找适合支撑基因测序发展的HPC(高性能计算解决方案)成为必须。

云时代,基因行业该如何乘势而为、蓄势而发?

某大学基因研究院认为基因测序技术带来的价值不可估量,可以检测先天遗传、肿瘤基因、预防癌症……这是有可能改变人类命运的关键技术。但涉足生物信息学领域的基因测序,需要高性能计算平台提供更强算力支持。

基因检测行业因自身的一些特性,对HPC的选择上有更为鲜明的行业要求:

1.对算力要求高:客户使用基因测序专用软件,用GPU来跑不够成熟稳定,需要运用CPU并行计算能力,因此对CPU的性能要求就变得更高了

2.对内存需求大:基因序列分析比对时要将海量数据一次性载入到内存并加以处理,不可分批导入,若内存不足将影响下一步计算工作

3.对成本把控严:考虑到成本投入和绿色环保,要求设计出具有性价比的HPC方案

经过缜密的选型,最终该大学选择了融科联创HPC解决方案,采用融科联创全新推出的2U4N(四节点)高性能服务器RH2285-A3,搭载AMD最新 EPYC处理器,稳定强大的计算系统有效支撑基因检测对数据分析的需求。

Roycom RH2285-A3  融合超融合服务器

★ 面向高性能计算、云计算以及超融合用户

★ 全新处理器架构带来的性能飙升

★ 高性能,高密度

★ 真正企业级的可靠性和可用性

融科联创HPC解决方案,帮助用户一改往日算力不足的难题,不仅为用户提供稳定耐用的HPC算力支持,在后期维护和技术保障上也能为用户提供了有力保障,帮助用户不断调优,让用户的经济投入获得更高的算力回报。

1.4倍算力,为基因测序加速度

融科联创HPC解决方案核心硬件RH2285-A3,搭载 AMD EPYC™ 7003/7002 系列处理器,最高支持CPU TDP 225W,本次项目搭配的是AMD 7702处理器,单颗CPU 核心数高达 64C,超线程更高达 128T,具有更高的三级缓存可达256M,大幅提升CPU与内存之间的协作效率;特别是在2U空间内包含4个独立的服务器节点,在相同空间内,可提供标准2U服务器4倍的算力支持,满足客户基因测序中对CPU并行计算能力的要求。

 

2.高带宽低延迟,加速科研成果转化

在同代相同容量内存中,内存频率越高,速度就越快。RH2285-A3单节点搭载16条 32G DDR4 3200 RECC内存,可大幅提高内存容量和带宽;同时单节点支持4片NVMe SSD硬盘,带宽效能提升2倍,读写效率大幅提升,为客户带来了高带宽、低延迟的极致体验,基因测序任务时间大幅缩短,满足了业务对时间的严苛要求。

 

3.性价比高,助推科研项目落地

在前期的搭配中,我们为客户选择了更具性价比的AMD 方案;相同空间占用情况下获得4倍算力提升,同时随着业务量增加,只需在当前架构下增加额外的计算资源即可实现平滑的性能升级,无需进行架构改动;在节能环保上,选择了钛金级冗余电源,转化率高达96%,最大限度节约资源成本,无论是前期还是后期都具有更高的性价比。

加速基因测序的研究,是惠泽医疗、造福人类的关键,融科联创牵手该大学基因研究院建立高性能计算集群,充分考虑到算力、成本、稳定性等问题,设计出加速基因测序科学研究的HPC整套系统,大幅提高了基因测序的计算、分析、处理功能,满足了客户在生命科学研究中对数据分析的需求。

融合超融合服务器RH2285-A3,凭借自身高性能、高密度、高可靠的特点,为客户提供了稳定、高效、安全的高性能计算系统,帮助客户解决了在基因测序场景中,海量基因数据所需要的数据分析能力,为科研项目的开展提供支撑。RC4280-I3-D36同时适用于高性能计算、虚拟化、云计算以及超融合等应用场景,保障各类计算业务顺利开展。